Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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