Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms