Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms