Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms