Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms