Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP58Q9BVL2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms