Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms