Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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