Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAF11Q99590 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAF11Q99590 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms