Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms