Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SENP8Q96LD8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms