Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CELF6Q96J87 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms