Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RPUSD4Q96CM3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RPUSD4Q96CM3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RPUSD4Q96CM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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