Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms