Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms