Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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GTF3C6Q969F1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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