Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms