Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD1Q8NHV4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms