Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms