Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD53Q8N9V6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms