Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms