Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRP11Q86VZ4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms