Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HECW1Q76N89 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms