Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms