Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms