Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETMD1Q6P1Q0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms