Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNS3Q68CZ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms