Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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