Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms