Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF628Q5EBL2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms