Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms