Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms