Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms