Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDRF1Q3B7T1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms