Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPHKAPQ2M3C7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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