Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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