Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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