Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CARTPTQ16568 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms