Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1AQ15573 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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