Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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