Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms