Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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