Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms