Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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