Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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