Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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