Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H2Q13888 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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