Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PKD2Q13563 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2Q13563 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms