Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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