Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA4Q13439 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms